SIMBAGraN

Sistem integrat pentru modelare biomoleculara,
cu aplicabilitate la studiul bacteriilor Gram negative

Obiectivul general al proiectului este de a dezvolta si implementa o infrastructura informatica pentru modelare si simulari biomoleculare, ca un instrument puternic de cercetare pentru comunitatea stiintifica si academica nationala. Pana la sfarsitul proiectului, infrastructura va furniza resurse si servicii pentru investigarea bacteriilor Gram negative, dar design-ul sistemului va permite adaptari ulterioare pentru investigarea diverselor structuri subcelulare, si imbunatatiri viitoare ale resurselor, pastrandu-se scalabilitatea in raport cu dimensiunea lor si numarul de utilizatori.

Obiective specifice

proiectarea si implementarea unui portal de aplicatii, dotat cu o interfata grafica prietenoasa, care va oferi acces usor la diverse instrumente software de modelare biomoleculara;
proiectarea si implementarea unui sistem grid de resurse de calcul de inalta performanta, care va prelua sarcinile de calcul intensiv;
dezvoltarea de nou software stiintific pentru automatizarea procedurilor de modelare, concepute ca fluxuri de lucru ale sarcinilor/modulelor;
obtinerea, prin utilizarea infrastructurii, de noi rezultate stiintifice privind relatia structura-functionalitate pentru membranele bacteriene si componente ale acestora, precum si pentru interactiunea medicament-bacterie.